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Póster

rptDB; un prototipo de herramienta de control de calidad de Affymetrix .rpt

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rptDB; un prototipo de herramienta de control de calidad de Affymetrix .rpt

El análisis de Affymetrix da como resultado la generación de conjuntos de datos grandes y complejos que necesitan un análisis posterior extenso para determinar los resultados de importancia biológica. Los usuarios pueden beneficiarse de un control de calidad cuidadoso de sus datos antes de comenzar el análisis para eliminar chips individuales que pueden afectar negativamente la interpretación final.

rptDB es una base de datos prototipo para el análisis de archivos de informes de expresión de Affymetrix .rpt. Los archivos de informes se utilizan ampliamente para controlar los datos sin procesar después de la generación de archivos hyb, scan y .cel. Solo% de llamadas presentes, factores de escala y 3 ':Generalmente se utilizan proporciones 5 'de genes de mantenimiento, pero hay muchas otras métricas que también pueden ser importantes para el análisis de CC.

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