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RAMclust / RAMsearch: agrupación y anotación de funciones post-XCMS eficiente de conjuntos de datos de metabolómica basados ​​en MS

La espectrometría de masas acoplada cromatográficamente es una herramienta poderosa para perfilar, semicuantitativa o cuantitativamente, una variedad de moléculas pequeñas con sensibilidad y selectividad.
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Análisis funcional de los SNP de RAD51B y RAD23B mediante captura de conformación de cromosomas circulares 4C en líneas celulares de próstata humana

El objetivo de este estudio es comprender el mecanismo detrás de la asociación entre los polimorfismos de un solo nucleótido SNP, que se encuentran en regiones no codificantes cerca o dentro de RAD51B y RAD23B, y el riesgo de cáncer de próstata mediante el análisis de sus interacciones con todo el genoma utilizando CircularCaptura de conformación cromosómica 4C.
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Un novedoso sistema GC-MS de tiempo de vuelo de sobremesa para análisis de alto rendimiento de orina humana

Se desarrolló e implementó un flujo de trabajo para la comparación efectiva de la orina. Implicó la preparación de compuestos estables mediante derivatización, adquisición de datos utilizando un TOFMS de sobremesa de alto rendimiento, procesamiento de datos integral NonTarget Deconvolution ™ y análisis retrospectivo rápido de conjuntos de datos ricosutilizando la búsqueda de analitos objetivo.
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Rutina de procesamiento de datos de plataforma agnóstica para la identificación de metabolitos dirigida y no dirigida en el descubrimiento de fármacos

Una discusión sobre una nueva solución informática que aborda los desafíos comunes en la identificación y caracterización de metabolitos, desde el procesamiento de datos LC / MS y la predicción de metabolitos hasta la elaboración de informes y la base de datos del conocimiento de biotransformación ensamblado.
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anomalías moleculares en la esquizofrenia: neurotransmisión, estrés oxidativo y apoptosis

Se empleó un enfoque multiplataforma para analizar distintas regiones del cerebro implicadas en la esquizofrenia.
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Variantes asociadas a la resistencia en las poblaciones del genotipo 1 del VHC

En este estudio investigamos específicamente los RAV que surgen en el genotipo 1 del VHC.
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Evaluación de la diversidad en la yuca mediante la aplicación de la metabolómica

En el presente estudio se establecieron plataformas metabolómicas para la yuca y se utilizaron para evaluar la biodiversidad presente en las colecciones de germoplasma de yuca y dilucidar los mecanismos bioquímicos subyacentes asociados con los rasgos de interés.
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Abordar las variantes falsas positivas que surgen de los pseudogenes

Las pruebas genéticas clínicas se han transformado en los últimos años con la introducción de la secuenciación de próxima generación NGS.
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Una tubería KNIME para el análisis de datos de GC-MS en metabolómica

Se desarrolló una tubería KNIME para realizar el preprocesamiento de datos de GC-MS de forma automatizada y se aplicó a un estudio de caso de enfermedades inflamatorias del intestino
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Cambios en el perfil metabólico de la orina del visón durante el embarazo temprano

El perfil metabólico de la orina de visones embarazadas mostró que la ß-oxidación y el metabolismo de las proteínas se modifican durante el embarazo en visones y se plantea la hipótesis de que los cambios se producen para garantizar una nutrición óptima de los fetos.
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