Hemos actualizado nuestro Política de privacidad para aclarar cómo usamos sus datos personales.

Usamos cookies para brindarle una mejor experiencia. Puede leer nuestro Política de cookies aquí.

Publicidad
Noticias

El tratamiento con enzimas ayuda a identificar las bacterias que viven en la piel

Noticias

El tratamiento con enzimas ayuda a identificar las bacterias que viven en la piel

Crédito: Karolina Grabowska / Pexels
tiempo de lectura :

En muchas enfermedades de la piel, como la dermatitis atópica y el acné, la capa bacteriana que protege la piel está dañada. "Nuestro objetivo es conocer el papel que desempeñan en estas enfermedades los diversos tipos de bacterias de la piel", dice el Dr. Martin Köberle, directordel Laboratorio de Dermatoinfectología del Klinikum Rechts der Isar de la Universidad Técnica de Munich TUM.

Los esfuerzos anteriores de los dermatólogos para investigar la composición detallada del microbioma se han topado con obstáculos. La razón: en los cultivos convencionales cultivados en placas de agar, no todas las bacterias prosperan y se multiplican igualmente bien. Como resultado, algunas especies de crecimiento lento pueden pasarse por altoLa desventaja de los métodos analíticos genéticos más recientes es que se capturan grandes cantidades de secuencias de ADN de células de la piel y fragmentos de bacterias muertas. Esto reduce el valor informativo de los resultados.

Separando el trigo genético de la paja


El Dr. Köberle y el biólogo Dr. Yacine Amar, ambos parte del equipo del Prof.Biedermann en la Clínica y Policlínica de Dermatología y Alergología en TUM, han desarrollado un método para eliminar el ADN de las especies no objetivo en cooperación con una organización internacional,equipo interdisciplinario. Utilizaron una característica especial de la enzima benzonasa. Destruye las cadenas de nucleótidos que transportan información hereditaria en todos los seres vivos al descomponerlos en fragmentos cortos. Solo las bacterias vivas cuyo ADN está protegido por una pared celular externa escapan a la destrucción por elenzima.

La benzonasa se ha utilizado durante algún tiempo, por ejemplo, para purificar proteínas: las enzimas rompen todos los fragmentos de ADN y ARN extraños. Estos pueden eliminarse en una centrifugadora, dejando atrás las proteínas. La selección de bacterias de la piel funciona de acuerdo con lamismo principio: el material genético de las células de la piel o de las bacterias muertas es descompuesto por la enzima y luego puede separarse de la muestra. Las bacterias restantes pueden destruirse mecánicamente, lo que permite el estudio de su ADN.

"Nuestros experimentos demostraron que, con este método, podemos eliminar por completo el ADN no objetivo y seleccionar el microbioma de la piel", dice el líder del proyecto Yacine Amar. En el laboratorio, inicialmente estudió muestras artificiales que contenían una mezcla de células humanas ybacterias muertas y vivas creadas mediante un protocolo estricto y pretratadas con benzonasa. "El proceso que se utilizó entonces, conocido como secuenciación 16S, arrojó una imagen muy precisa de la composición de las bacterias intactas", dice el investigador. El análisis de piel realLos hisopos tuvieron el mismo éxito: no se encontró ADN residual de bacterias muertas en las muestras.

El Dr. Köberle confía en que este enfoque también jugará un papel clave en la investigación futura: “La selección basada en enzimas de bacterias vivas de la piel puede ayudarnos a encontrar biomarcadores microbianos para ciertas enfermedades dermatológicas y también a identificar las bacterias que tieneninfluencia positiva en el curso de la enfermedad. Quizás algún día se utilicen en tratamientos ”. El nuevo método para el análisis de microbiomas ya se está utilizando en muchos estudios de cohortes sobre enfermedades de la piel en la Clínica TUM y Policlínica de Dermatología.

Referencia : Amar Y, Lagkouvardos I, Silva RL, et al. La predigestión de ADN no protegido por Benzonase mejora la representación de bacterias vivas de la piel y agota de manera eficiente el ADN del huésped. microbioma . 2021; 9 1: 123. Doi: 10.1186 / s40168-021-01067-0

Este artículo se ha vuelto a publicar a partir de lo siguiente materiales . Nota: el material puede haber sido editado por su extensión y contenido. Para obtener más información, comuníquese con la fuente citada.


Publicidad